У Полтавській єпархії діють наступні відділи:

• Єпархіальний інформаційний відділ
• Єпархіальний відділ у справах сім’ї
• Єпархіальний відділ благодійності та соціального служіння
• Єпархіальний відділ роботи з молоддю
• Єпархіальний відділ по співпраці з правоохоронними органами та установами виконання покарань
• Єпархіальний відділ по взаємодії зі Збройними силами
• Єпархіальний відділ релігійної освіти, катехізації та місіонерства